Tiny Earth Danmark har de sidste fire år involveret danske gymnasieelever i jagten på antibiotikaproducerende bakterier fra jord. Der er fundet flere hundrede bakterier med antimikrobiel aktivitet, men hvilke bakterier producerer ny antibiotika og hvilke bakterier producerer antibiotika, vi allerede kender? I år tilbyder vi nysgerrige gymnasieelever at vende tilbage og hjælpe os med at besvare spørgsmålet som en del af deres SRP eller SOP (forårstermin).
De eksperimentielle øvelser i vores SRP/SOP forløb bygger videre på forsøgene fra vores Tiny Earth undervisningsforløb og egner sig derfor særligt godt til elever, der allerede har stiftet bekendtskab med Tiny Earth. 

I skoleåret 2024/2025 tilbyder vi to SRP/SOP forløb, som begge forløber over to dage d. 20 og d. 21 januar 2025. Programmet findes her.

Forløb 1: Genomsekventering og bioinformatik
I dette forløb får eleverne mulighed for at dykke ned i genomer fra antibiotikaproducerende bakterier. Eleverne vil høre foredrag fra forskere og studerende, som vil give dem indblik bl.a. i genome mining og hvordan vi benytter genetisk information til at identificere og forudsige produktionen af et antibiotisk stof i en bakterie. I forløbets tre øvelser vil eleverne benytte bioinformatiske værktøjer til at bygge fylogenetiske træer samt forudsige det enzymatiske maskineri involveret i produktionen af et antibiotisk stof. Eleverne vil understøtte fundene in silico med eksperimentelle øvelser i laboratoriet.

Forløb 2: Oprensning af antibiotika 
I dette forløb får eleverne mulighed for at oprense antibiotiske stoffer udskilt af bakterier i flydende kulturer bl.a. ved hjælp af analytisk kemiske metoder. Eleverne vil høre foredrag om bl.a. bioteknologisk produktion og oprensningsstrategier, inden de selv skal have hænderne i det. I forløbets øvelser vil eleverne prøve kræfter med separation, ekstraktion med organisk solvent og HPLC kørsel. Eleverne vil følge oprensningen af stoffet ved løbende at teste fraktionerne fra hvert forsøg for bioaktivitet. 

Øvelsesvejledninger og relevant litteratur følger her på siden.